1. 成大講座教授
2. 大學搶好教授 薪資無上限
3. 北醫本世紀第一個十年
5. 台大、成大、清大、交大、中央研究院、長庚、中興、陽明的國際影響
6. 台灣高引用論文的表現
7. 北醫傳奇完結片
9. 北醫公衛學院22/11/2006（錄音檔）
10. 北醫人事室01/03/2007（錄音檔）
11. 北醫公衛系06/06/2006（錄音檔）
12. 北醫人事室23/06/2006（錄音檔）
13. 升等路
14. 真相
15. 北京大學任職及發表論文事宜
16. 2003許校長的推薦
17. 張文昌院士請願
18. 張董事回信
19. 北醫論文獎陳情
20. 調查報導
21. 2006給國科會陳主委的信
22. 國科會陳主委回函
23. 國家科會九十三年度傑出研究獎 附件
24. 2003給國科會魏主委的信
25. 國科會研究表現指數（RPI）
26. 北醫九十四年度研究論文獎
27. 省思國科會研究獎勵制度
28. 2002年申請國科會計畫 結果
29. 2001年初次申請國科會計畫 結果 申覆 申覆案審查結果 報導
30. 2002年國科會「一元計畫」 結果 申冤
31. 國科會陳情監察院
32. 國科會答覆 2002
33. 改聘副教授案陳情監察院
34. 教育部答覆2003
35. 北醫獨立研究(2013-11-01)
36. 孫以瀚副主委室意見信箱2012
37. 科技部-1 2014 科技部-1 答覆 科技部-2 2014
38. 教育部部長信箱-1 2014 教育部部長信箱-1 答覆